home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3151.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  3KB  |  46 lines
  1.        Document 3151
  2.  DOCN  M94A3151
  3.  TI    HIV 'tat' gene is homologous with regions in HSV and EBV suggesting
  4.        possible basis for synergism.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Smith RW; Inst. for Postgrad. Interdisc. Stud., Palo Alto, CA
  7.        94306-0846.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):141 (abstract no. PA0185). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369424
  10.  AB    OBJECTIVE: Synergism among lentiviruses and herpesviruses (especially
  11.        gamma herpesviruses) is well known but poorly understood. One report of
  12.        superinfections with lentiviruses and herpesviruses suggests that
  13.        herpesviruses may activate lentiviruses. We reported that tat and 5
  14.        other HIV regulatory genes may account for the recessively functional
  15.        slowly progressive features, with there being 6 homologues in a 10,366
  16.        base pair region on 4p16.3 possibly accounting for recessively
  17.        functional slowly progressive features of Huntington's disease. Because
  18.        of dormant and latent features of some herpesviruses, we now inquire if
  19.        tat and other HIV regulatory genes are homologous with regions in
  20.        herpesviruses, especially in view of their synergism with the
  21.        lentiviruses. METHODS: Genetic prospecting, a heuristic browsing tool
  22.        combining FindSeq (sequence location algorithm), FastDB (fast pairwise
  23.        sequence comparisons), CLUSTAL V (multiple sequence alignment), and
  24.        TBLASTN (a basic local alignment search tool). RESULTS: Significant
  25.        homologues of tat were found in EBV (smallest Poisson probability [sPp]
  26.        = 0.46), HSV-1 (sPp = 0.014) and HSV-2 (sPp = 0.51). A homologue of tat
  27.        also is found in a bovine herpesvirus (sPp = 0.26). DISCUSSION AND
  28.        CONCLUSIONS: EBV and HSV are remarkable for their latent and productive
  29.        phases. When combined with the finding of homologues of tat and other
  30.        HIV genes implicated in recessive functions, this may account for
  31.        dormant and latent phases while also explaining their synergism with
  32.        lentiviruses. Synthesis and analysis of HIV homologues remains a subject
  33.        for future investigation, as is the 'genetic prospecting' for other
  34.        homologues relevant to slowly progressive features of lentiviruses or
  35.        genetic diseases.
  36.  DE    Algorithms  Base Sequence  Chromosome Mapping  Chromosomes, Human, Pair
  37.        4  Comparative Study  *Genes, tat  *Genes, Regulator  *Genes, Viral
  38.        Herpesvirus 1, Bovine  Herpesvirus 4, Human/*GENETICS  Human
  39.        Huntington's Disease/GENETICS  HIV/*GENETICS  Lentivirus/*GENETICS
  40.        Poisson Distribution  Probability  Sequence Homology, Nucleic Acid
  41.        Simplexvirus/*GENETICS  MEETING ABSTRACT
  42.  
  43.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  44.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  45.  
  46.